Le Cetip est leader dans la gestion du tiers payant santé en tant qu'opérateur historique de l’Association Santé-Pharma depuis 1991.

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La plateforme de réception et de gestion des flux du Cetip a traité, en 2010, 106 millions de factures de tiers-payant santé par an, dont 98% en télétransmission, avec le plus fort taux de Demandes de Remboursement Electroniques (DRE) 1.40 sécurisées du marché.
Le Cetip prend en charge, pour ses clients, l’ensemble des évolutions réglementaires et techniques relatives au tiers-payant (norme SESAM-Vitale 1.40, Classification Commune des Actes Médicaux, DRE, gestion du parcours de soins, etc.). Le système d'information du Cetip est maintenu par les équipes informatiques du groupe Cegedim.

A ce jour, le tiers-payant se généralise à l'ensemble des professions de santé.

Le Cetip opère en partenariat avec la Fédération Française des Sociétés d'Assurance et Sintia pour la maîtrise d'ouvrage déléguée. 

Plus de 222 organismes d’Assurance Maladie Complémentaire (AMC), près de 100 000 professionnels de santé et 12 millions de bénéficiaires à travers SP santé, font confiance au Cetip depuis plus de 18 ans.